在前往南太平洋的途中，柯南和灰原哀与国际刑警组织的专家团队一起，根据现有的线索和情报，对神秘组织的新计划进行了更深入的推测。他们认为，神秘组织可能打算利用海底基地的特殊地理位置和强大的生物技术设备，制造一种能够在全球范围内迅速传播的生态病毒，这种病毒一旦释放，将引发全球性的生态灾难，从而实现他们重塑世界秩序的疯狂目标。

“我们必须在他们完成病毒研发之前摧毁这个基地。”柯南说道，语气中充满了坚定。

当他们抵达南太平洋与侦察队会合后，立刻展开了紧张的准备工作。为了应对海底基地复杂的环境和强大的防御系统，他们准备了先进的潜水装备、水下武器以及能够干扰敌人通讯和防御系统的电子设备。

经过精心策划，突袭行动在深夜展开。队员们身着特制的潜水服，悄无声息地潜入海中，朝着海底基地游去。在接近基地时，他们遭遇了基地外部的自动防御系统，一道道激光束在海水中闪烁。

队员们利用事先准备好的干扰设备，成功地干扰了防御系统的运行，为自己争取到了宝贵的时间。他们迅速突破防御，进入了海底基地内部。

基地内部灯光昏暗，通道错综复杂。柯南和灰原哀带领队员们小心翼翼地前进，时刻警惕着敌人的袭击。在基地的核心区域，他们终于找到了正在研发中的生态病毒样本以及相关的技术资料。

“就是这些，绝不能让它们落入敌人手中。”柯南说道。

然而，就在他们准备销毁病毒样本和资料时，神秘组织的成员们闻讯赶来，将他们团团包围。

“你们以为能轻易破坏我们的计划吗？今天就是你们的葬身之地。”神秘组织的一名头目恶狠狠地说道。

一场惊心动魄的最终对决即将展开，柯南和他的伙伴们能否成功摧毁病毒，阻止神秘组织的疯狂计划，一切都还是未知数......